Pro přihlášení do systémů Moodle pro výuku, další vzdělávání, Mefanet je třeba použít přihlašovací údaje, uživatelské jméno a heslo, z Centrální autentizační služby UK (CAS), kterým se ověřuje příslušnost uživatele k UK. Přihlášení prostřednictvím CAS současně uživatelům umožňuje používat pro přístup do Moodle stejné přihlašovací údaje jako pro ostatní aplikace Informačního systému UK. Pro přihlášení do Moodle UK je nutné mít v CAS zadanou platnou e-mailovou adresu, kterou lze upravovat v profilu uživatele po přihlášení do CAS.

Uživatelé Moodle – Mefanet mimo UK se hlásí svými lokálními přihlašovacími údaji pomocí služby Shibboleth.

Pro přihlášení do systému Moodle – hostování kurzů je nutno vytvořit si účet pomocí registračního formuláře systému Moodle – hostování kurzů.